1.企業(yè)基本情況
某省中煙工業(yè)公司于2004年成立，為增值稅一般納稅人及所得稅匯總繳納企業(yè)，系中國煙草總公司全資子公司，注冊資金178771900元。主要職能為對全省卷煙工業(yè)企業(yè)的生產經營實施管理，下轄A、B、C、D、E、F六個卷煙生產點。2007年末，全公司從業(yè)人數(shù) 12169人，退休人員4345人，離休人員45人。
在財務稅收管理方面，實行主要業(yè)務集中管理，財務統(tǒng)一核算，垂直管理的財務會計管理體制。執(zhí)行《工業(yè)企業(yè)會計制度》，以權責發(fā)生制為記賬基礎，各卷煙廠會計機構主要負責對本單位卷煙生產成本、生產費用、固定資產管理、負責所在地應分配的增值稅、消費稅、城建稅、教育費附加在當?shù)囟悇諜C關的申報、解繳入庫。
2004年聯(lián)合重組后，該公司在業(yè)務上實現(xiàn)了卷煙生產調度、卷煙銷售、煙葉和主要卷煙材料采購的集中統(tǒng)一管理，在財務上全省卷煙工業(yè)實現(xiàn)了統(tǒng)一核算，企業(yè)所得稅實行統(tǒng)一核算、集中申報和繳納。
該公司2006年度銷售2110451箱，實現(xiàn)銷售收入1210977萬元，凈利潤76901萬元，入庫稅費總計686860萬元，其中，增值稅142458元、消費稅452535萬元、企業(yè)所得稅30947萬元。2007年度銷售2208165箱，實現(xiàn)銷售收入1389852萬元，凈利潤117422萬元，入庫稅費總計760436萬元，其中，增值稅157248元、消費稅496260萬元、企業(yè)所得稅36037萬元。
2.評估分析
根據(jù)企業(yè)兩個年度的企業(yè)所得稅匯算清繳申報情況及日常管理信息，2009年主管稅務機關對該公司的2006年~2007年企業(yè)所得稅進行專項評估。
評估人員主要分析了兩個年度企業(yè)所得稅的稅收負擔率：
2006年度稅收負擔率=繳納的企業(yè)所得稅30947萬元÷凈利潤76091萬元×100%=40.67%
2007年度稅收負擔率=繳納的企業(yè)所得稅36037萬元÷凈利潤117422萬元×100%=30.69%
兩個年度的企業(yè)所得稅稅收負擔率差異較大，評估人員把重點放在了某成本費用等扣除項目是否符合規(guī)定方面。
3.稅務約談
評估人員向企業(yè)發(fā)出了《納稅評估約談說明建議書》，指出異常涉稅指標，并要求企業(yè)對評估初步確認的問題進行自查，并做出合理的解釋。企業(yè)非常重視，立即組織了對2006年、2007年納稅情況的稅收自查。經過自查，該公司補申報繳納企業(yè)所得稅2972萬元。但評估人員對企業(yè)自查情況進行分析后，決定到企業(yè)進行實地核查。
4.實地核查
評估人員通過實地核查發(fā)現(xiàn)該企業(yè)存在下列問題：
（1）列支與企業(yè)生產經營無關的費用未作納稅調整
①A卷煙廠2006年6月，在“管理費用——勞動保險費”科目中列支生活服務公司（生活服務公司是獨立核算的法人）解除合同工一次性經濟補償費227311.00元。
②C卷煙廠2007年12月在“營業(yè)外支出”中列支下屬關聯(lián)企業(yè)麻布廠勞服公司人員安置費765499.00元。
（2）多計成本未作納稅調整
該公司本部2006年6月，因串牌多列成本2052749.40元未調增應納稅所得額，違反了《企業(yè)所得稅稅前扣除辦法》（國稅發(fā)【2000】84號）第四條第（八）項的規(guī)定，應調增應納稅所得額2052749.40元。
（3）修建固定資產計入當期費用未作資本化未作納稅調整
①D卷煙廠2006年12月修建廠區(qū)圍墻直接記入當期損益，違反了《中華人民共和國企業(yè)所得稅暫行條例實施細則》第二十九條的規(guī)定，應調增應納稅所得額58807.5元。
②A卷煙廠2006年12月在“制造費用—設備維修—設備大、中修費”科目列支FK機大修理所領用的備品備件75113.55元，違反了《企業(yè)所得稅稅前扣除辦法》（國稅發(fā)【2000】84號）第三十一條的規(guī)定，應調增應納稅所得額75113.55元。
（4）費用重復列支
D卷煙廠2006年12月在當期損益中列支屬于福利費性質的支出71056.10元，違反了《企業(yè)所得稅稅前扣除辦法》（國稅發(fā)【2000】84號）第四條第（三）項及企業(yè)會計制度“應付福利費”的相關規(guī)定，造成費用重復列支，應調增應納稅所得額71056.10元。
（5）發(fā)放勞保用品款（補貼）未作工資性支出
該公司本部2007年12月在“管理費用”中列支車隊2007年度勞保用品款14400元，違反了《企業(yè)所得稅稅前扣除辦法》（國稅發(fā)【2000】84號）第五十四條的規(guī)定，應調增應納稅所得額14400元。
5.評估處理
根據(jù)實地核查情況，該公司應調增應納稅所得額3037625.55元（其中，2006年2485037.55元，2007年552588.00元），根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅暫行條例》第三條的規(guī)定，應繳納企業(yè)所得稅1002416.43元（其中，2006年820062.39元，2007年182354.04元）。
