對于期末一次性進行賬務處理的企業，期末，按規定當期允許扣減銷售額而減少的銷項稅額，借記“應交稅費——應交增值稅（營改增抵減的銷項稅額）”科目，貸記“主營業務成本”等科目
案例1：
北京市甲運輸公司是增值稅一般納稅人，2012年9月取得全部收入200萬元，其中，國內客運收入185萬元，支付非試點聯運企業運費50萬元并取得交通運輸業專用發票，銷售貨物取得支票12萬元，運送該批貨物取得運輸收入3萬元。假設該企業本月無進項稅額，期初無留抵稅額（單位：萬元）。請分析甲運輸公司應如何賬務處理？
分析：
由于客運收入屬于交通運輸業，屬于營業稅改征增值稅的應稅服務，適用的增值稅率為11%，銷售貨物屬于增值稅應稅貨物，稅率為17%.因此，甲運輸公司銷售額為（185 3-50）÷（1 11%） 12÷（1 17%）=104.85（萬元）。
甲運輸公司應交增值稅額為（185 3-50）÷（1 11%）×11% 12÷（1 17%）×17%=15.42（萬元）。
試點納稅人接受非試點營業稅納稅人聯運業務，銷售額要按差額計算。根據《交通運輸業和部分現代服務業營業稅改征增值稅試點有關事項的規定》規定，試點納稅人提供應稅服務的銷售額，按照國家有關營業稅政策規定差額征收營業稅的，允許其以取得的全部價款和價外費用，扣除支付給非試點納稅人（指試點地區不按照試點實施辦法繳納增值稅的納稅人和非試點地區的納稅人）價款后的余額為銷售額。
甲運輸公司取得收入的會計處理：
借：銀行存款200
貸：主營業務收入179.63
應交稅費——應交增值稅（銷項稅額）20.37[（185 3）÷（1 11%）×11% 12÷（1 17%）×17%]
支付聯運企業運費：
借：主營業務成本45.05
應交稅費——應交增值稅（營改增抵減的銷項稅額）4.95[50÷（1 11%）×11%]
貸：銀行存款50
假設本案例中的增值稅一般納稅人甲運輸公司支付試點聯運企業（小規模納稅人）運費50萬元并取得交通運輸業專用發票，其他條件不變。則根據《交通運輸業和部分現代服務業營業稅改征增值稅試點有關事項的規定》的規定，試點納稅人接受試點納稅人中的小規模納稅人提供的交通運輸業服務，按照取得的增值稅專用發票上注明的價稅合計金額和7%的扣除率計算進項稅額。
甲運輸公司銷項稅額為（185 3）÷（1 11%）×11% 12÷（1 17%）×17%=20.37（萬元）。
甲運輸公司可抵扣進項稅額為50×7%＝3.5（萬元）。
借：銀行存款200
貸：主營業務收入179.63
應交稅費——應交增值稅（銷項稅額）20.37
支付聯運小規模納稅人企業運費：
借：主營業務成本46.5
應交稅費——應交增值稅（進項稅額）3.5
貸：銀行存款50
假設支付試點聯運企業（一般納稅人）運費價稅合計50萬元并取得增值稅專用發票，其他條件不變。則甲運輸公司可抵扣進項稅額：50÷（1 11%）×11%=4.95（萬元）。
甲運輸公司提供服務取得收入的會計處理：
借：銀行存款200
貸：主營業務收入179.63
應交稅費——應交增值稅（銷項稅額）20.37
支付聯運一般納稅人企業運費：
借：主營業務成本45.05
應交稅費——應交增值稅（進項稅額）4.95
貸：銀行存款50
2、小規模納稅人差額征稅的會計處理
根據財會[2012]13號文件規定，小規模納稅人提供應稅服務，試點期間按照營業稅改征增值稅有關規定，允許從銷售額中扣除其支付給非試點納稅人價款的，按規定扣減銷售額而減少的應交增值稅，應直接沖減“應交稅費——應交增值稅”科目。企業接受應稅服務時，按規定允許扣減銷售額而減少的應交增值稅，借記“應交稅費——應交增值稅”科目，按實際支付或應付的金額與上述增值稅額的差額，借記“主營業務成本”等科目，按實際支付或應付的金額，貸記“銀行存款”、“應付賬款”等科目。對于期末一次性進行賬務處理的企業，期末，按規定當期允許扣減銷售額而減少的應交增值稅，借記“應交稅費——應交增值稅”科目，貸記“主營業務成本”等科目。
案例2：
北京市甲運輸公司是小規模納稅人，2012年9月取得全部收入200萬元，其中，國內客運收入185萬元，支付非試點聯運企業運費50萬元并取得交通運輸業專用發票，銷售貨物取得支票12萬元，運送該批貨物取得運輸收入3萬元。假設該企業本月無進項稅額，期初無留抵稅額（單位：萬元）。請分析甲運輸公司應如何賬務處理？
分析：
因為增值稅應稅貨物和應稅勞務小規模納稅人征收率均為3%，所以甲運輸公司應交增值稅額為（185 3-50）÷（1 3%）×3% 12÷（1 3%）×3%=4.37（萬元）。
對于小規模增值稅納稅人增值稅的核算，一般只設“應交稅費——應交增值稅”科目，對于按規定扣減銷售額而減少的銷項稅額，不再單獨設立科目。
甲運輸公司提供服務取得收入會計處理為：
借：銀行存款200
貸：主營業務收入194.17
應交稅費——應交增值稅5.83[（185 3）÷（1 3%）×3% 12÷（1 3%）×3%]
支付聯運企業運費：
借：主營業務成本48.54
應交稅費——應交增值稅1.46[50÷（1 3%）×3%]
貸：銀行存款50
假設本案例中的小規模納稅人北京市甲運輸公司支付試點聯運企業運費50萬元并取得交通運輸業專用發票，其他條件不變。則甲運輸公司應賬務處理分析如下：
分析：
根據《交通運輸業和部分現代服務業營業稅改征增值稅試點有關事項的規定》規定，試點納稅人中的小規模納稅人提供交通運輸業服務和國際貨物運輸代理服務，按照國家有關營業稅政策規定差額征收營業稅的，其支付給試點納稅人的價款，也允許從其取得的全部價款和價外費用中扣除。因為增值稅應稅貨物和應稅勞務小規模納稅人征收率均為3%，所以甲運輸公司應交增值稅額為（185 3-50）÷（1 3%）×3% 12÷（1 3%）×3%=4.37（萬元）。
對于小規模增值稅納稅人增值稅的核算，一般只設“應交稅費——應交增值稅”科目，對于按規定扣減銷售額而減少的銷項稅額，不再單獨設立科目。
甲運輸公司提供服務取得收入會計處理為：
借：銀行存款200
貸：主營業務收入194.17
應交稅費——應交增值稅5.83[（185 3）÷（1 3%）×3% 12÷（1 3%）×3%]
支付聯運企業運費：
借：主營業務成本48.54
應交稅費——應交增值稅1.46[50÷（1 3%）×3%]
貸：銀行存款50
（二）增值稅期末留抵稅額的會計處理
根據財會[2012]13號文件的規定，試點地區兼有應稅服務的原增值稅一般納稅人，截止到開始試點當月月初的增值稅留抵稅額按照營業稅改征增值稅有關規定不得從應稅服務的銷項稅額中抵扣的，應在“應交稅費”科目下增設“增值稅留抵稅額”明細科目。
開始試點當月月初，企業應按不得從應稅服務的銷項稅額中抵扣的增值稅留抵稅額，借記“應交稅費——增值稅留抵稅額”科目，貸記“應交稅費——應交增值稅（進項稅額轉出）”科目。待以后期間允許抵扣時，按允許抵扣的金額，借記“應交稅費——應交增值稅（進項稅額）”科目，貸記“應交稅費——增值稅留抵稅額”科目。“應交稅費——增值稅留抵稅額”科目期末余額應根據其流動性在資產負債表中的“其他流動資產”項目或“其他非流動資產”項目列示。
（三）取得過渡性財政扶持資金的會計處理
試點納稅人在新老稅制轉換期間因實際稅負增加而向財稅部門申請取得財政扶持資金的，期末有確鑿證據表明企業能夠符合財政扶持政策規定的相關條件且預計能夠收到財政扶持資金時，按應收的金額，借記“其他應收款”等科目，貸記“營業外收入”科目。待實際收到財政扶持資金時，按實際收到的金額，借記“銀行存款”等科目，貸記“其他應收款”等科目。
（四）增值稅稅控系統專用設備和技術維護費用抵減增值稅額的會計處理
1、增值稅一般納稅人的會計處理
按稅法有關規定，增值稅一般納稅人初次購買增值稅稅控系統專用設備支付的費用以及繳納的技術維護費允許在增值稅應納稅額中全額抵減的，應在“應交稅費——應交增值稅”科目下增設“減免稅款”專欄，用于記錄該企業按規定抵減的增值稅應納稅額。
企業購入增值稅稅控系統專用設備，按實際支付或應付的金額，借記“固定資產”科目，貸記“銀行存款”、“應付賬款”等科目。按規定抵減的增值稅應納稅額，借記“應交稅費——應交增值稅（減免稅款）”科目，貸記“遞延收益”科目。按期計提折舊，借記“管理費用”等科目，貸記“累計折舊”科目；同時，借記“遞延收益”科目，貸記“管理費用”等科目。
企業發生技術維護費，按實際支付或應付的金額，借記“管理費用”等科目，貸記“銀行存款”等科目。按規定抵減的增值稅應納稅額，借記“應交稅費——應交增值稅（減免稅款）”科目，貸記“管理費用”等科目。
2、小規模納稅人的會計處理
按稅法有關規定，小規模納稅人初次購買增值稅稅控系統專用設備支付的費用以及繳納的技術維護費允許在增值稅應納稅額中全額抵減的，按規定抵減的增值稅應納稅額應直接沖減“應交稅費——應交增值稅”科目。
企業購入增值稅稅控系統專用設備，按實際支付或應付的金額，借記“固定資產”科目，貸記“銀行存款”、“應付賬款”等科目。按規定抵減的增值稅應納稅額，借記“應交稅費——應交增值稅”科目，貸記“遞延收益”科目。按期計提折舊，借記“管理費用”等科目，貸記“累計折舊”科目；同時，借記“遞延收益”科目，貸記“管理費用”等科目。
企業發生技術維護費，按實際支付或應付的金額，借記“管理費用”等科目，貸記“銀行存款”等科目。按規定抵減的增值稅應納稅額，借記“應交稅費——應交增值稅”科目，貸記“管理費用”等科目。
“應交稅費——應交增值稅”科目期末如為借方余額，應根據其流動性在資產負債表中的“其他流動資產”項目或“其他非流動資產”項目列示；如為貸方余額，應在資產負債表中的“應交稅費”項目列示。
