一、還原法
（一）含稅支付額還原法
所謂含稅支付額還原法，是指稅法規定進項稅額按含稅支付額直接計算，但賬面所提供的計算進項稅額轉出的支付額是扣除了進項稅額之后的支付額，需要進行價格還原，然后再依據所適用的進項稅額扣除率計算確定應轉出的進項稅額。其計算公式：
應轉出的進項稅額＝應轉出進項稅的貨物成本÷（1－進項稅額扣除率）×進項稅額扣除率
此方法主要用于特定外購貨物，即購入時未取得增值稅專用發票，但可以依據支付價格計算抵扣進項稅額的外購貨物，如從農業生產者手中或從小規模納稅人手中購入的免稅農產品；從專門從事廢舊物資經營單位購入的廢舊物資，以及企業銷售商品、外購貨物所支付的運費等。
例：某酒廠3月份從農民手中購入玉米一批，作為生產原料，收購價為100萬元，支付運費2萬元。該酒廠當月申報抵扣的進項稅額13.14萬元，記入材料成本的價格為88.86萬元。4月份酒廠將玉米的一部分用于非應稅項目，移用成本65萬元，其中運費1.25萬元。
依據上述方法，該部分玉米進項稅轉出數額則為63.75÷（1－13%）×13%＋1.25÷（1－7%）×7%＝9.526+0.094=9.62（萬元），而不是63.75×13%＋1.25×7%＝8.38（萬元）。
（二）含稅收入還原法
所謂含稅收入還原法，是指稅法規定進項稅額按不含稅支付額計算，但賬面提供的計算進項稅額轉出的收入額（返還的支付額）是含稅的，需要進行價格還原，再按適用的進項稅額扣除率計算確定應轉出的進項稅額。其計算公式為：應沖減的進項稅額＝當期取得的返還資金÷（1＋所購貨物適用的增值稅稅率）×所購貨物適用的增值稅稅率
此方法適用于納稅人外購貨物時從銷貨方取得的各種形式返還資金的進項稅轉出的計算。
例：某商業企業向某生產企業購進一批貨物，價款30000元，增值稅額5100元。當月從生產企業取得返還資金11700元，增值稅率17%.則：
當月應沖減的進項稅額＝11700÷（1＋17%）×17%＝1700（元）
二、比例法
（一）成本比例法
所謂成本比例法，是指根據需要依法進行進項稅額轉出的貨物成本占某批貨物總成本或產成品、半成品、某項目總成本的比例，確定實際應轉出的進項稅額。該方法主要適用于貨物改變用途，產成品、半成品發生非正常損失等的進項稅轉出。由此成本比例法又可分為移用成本比例法與當量成本比例法。
1.移用成本比例法
應轉出的進項稅額＝某批外購貨物總的進項稅額×貨物改變用途的移用成本÷該批貨物的總成本
例：某一般納稅人3月份將一批從小規模納稅人購入的免稅農產品（收購價30萬元，運輸費1萬元）委托A廠（一般納稅人）加工半成品，支付加工費5萬元，增值稅0.85萬元，當月加工完畢收回。4月份該納稅人將其中的一部分用于非應稅項目，移用成本為20萬元。
此批產品的總成本為：（30－3.9）＋（1－0.07）＋5＝32.03（萬元）
此批產品的進項稅額為：30×13%＋1×7%＋0.85＝4.82（萬元）
應轉出的進項稅額為：20÷32.03×4.82＝3.01萬元
2.當量成本比例法
應轉出的進項稅額＝非正常損失中損毀在產品、產成品或貨物數量×單位成本×進項稅額扣除率×外購扣除項目金額占產成品、半成品或項目成本的比例
例：2002年3月，某紡織廠因工人違章作業發生一起火災，燒毀庫存外購原材料腈綸20噸、庫存產成品針織布6萬米；已知原材料晴綸每噸成本8萬元（不含稅），針織布單位成本每萬米20萬元。原材料占產成品成本的比例為75%.
應轉出的進項稅額：20×8×17%＋6×20×75%×17%＝42.5（萬元）
（二）收入比例法
所謂收入比例法是指根據納稅人當期的非應稅收入占總收入的比例，計算確定當期非應稅收入應承擔的進項稅轉出額。此方法適用于納稅人兼營免稅項目或非應稅項目（不包括固定資產在建工程）而無法劃分出不得抵扣的進項稅額的情況。其計算公式為：
不得抵扣的進項稅額＝本期全部進項稅額×免稅或非應稅項目的銷售額÷全部銷售額
例：某制藥廠（一般納稅人），主要生產銷售各類藥品，2003年3月，該廠購進貨物的進項稅額為20萬元，當月藥品銷售收入250萬元，其中避孕藥品銷售收入50萬元。
當月不得抵扣的進項稅額：20×50÷250＝4（萬元）
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